تقوم إدارة التراخيص بتلقي ودراسة طلبات منح وتجديد تراخيص أنشطة الأسواق المالية من أعمال وخدمات مالية يتم ممارستها من قبل سوق مالية منظمة او جهة إيداع او شركة مقاصة او شركة خدمات مالية، وغيرها من الجهات الخاضعة لرقابة الهيئة. كما تقوم الإدارة بتلقي ودراسة طلبات اعتماد الأفراد لمزاولة الوظائف الخاضعة لرقابة الهيئة بمنح التراخيص أو الموافقة، بالإضافة إلى طلبات تسجيل المدققين الخارجيين والمقيمين الماليين للجهات المدرجة والجهات الخاضعة لرقابة الهيئة.

وتحدد شروط وضوابط وإجراءات منح هذه التراخيص، ومعايير ممارسة النشاط، بموجب اللوائح والنظم والقرارات الصادرة عن مجلس إدارة الهيئة وفقا لأحكام القانون.